Ciudad Academis es un lugar muy desarrollado en términos de tecnología. Se dice que es de 20 a 30 años por delante del resto del mundo. El 80 % de sus 2.3 millones de residentes son estudiantes. El enfoque de los estudios aquí se dirige a los poderes Esper. Misaka Mikoto, una de las personas con poderes de nivel superior en la ciudad, comparte una habitación con Kuroko Shirai, otra esper alto nivel que es un miembro de los Judgment, una agencia integrada por los estudiantes. Ambas asisten a Tokiwadai, una escuela privada reservada a los altos niveles y los ricos. Kuroko socia en los Judgment, Kazari Uiharu, es una esper bajo nivel que estudia en la escuela media Sakugawa. Su mejor amiga y compañera de clase Ruiko Saten, de nivel (sin poderes Esper). Juntas, las cuatro viviran aventuras emocionantes en la ciudad científica.
